Jedes Produkt im Futtermittelbereich kennt die Salmonellenproblematik. Gemäß EU-Einfuhrgesetz ist Fischmehl grundsätzlich auf einen möglichen Salmonellenbefall zu untersuchen. Sollte dieser Fall eintreten, so besteht die Notwendigkeit der Sterilisierung (von den Veterinärbehörden vorgeschrieben).

Zu den schonendsten und zuverlässigsten Verfahren gehört die thermische Sterilisierung. Es sorgt für eine Salmonellenabtötung ohne Veränderung der wertbestimmenden Inhaltsstoffe. Das Herzstück der thermischen Sterilisierungsanlage des Bremer Terminals besteht seit 1983 - mit einer kontinuierlichen technischen Anpassung. Der Geruch wird durch die Desodorierungsanlage mittels Plasmaverfahren kontrolliert, welche eine Verringerung der Geruchseinheiten auf 1.000 per cbm ermöglicht. Der Durchlauf der Ware in der Sterilisierungsanlage beträgt 20 to pro Stunde bei einer Temperatur von mindestens 80 Grad über 30 Minuten.